1.目前使用的環氧乙烷滅菌器種類很多，大型的容器有數十立方米，中等的有1～10立方米，小型的有零點幾至1立方米。它們各有不同的用途。
2.大型環氧乙烷滅菌器：一般用于大量處理物品的滅菌，用藥量為0.8kg/m～1.2kg/m，在55℃～60℃下作用6h。
3.中型環氧乙烷滅菌器：一般用于一次性使用診療用品的滅菌。這種滅菌設備完善，自動化程度高，可用純環氧乙烷或環氧乙烷和二氧化碳混合氣體。一般要求滅菌條件為：濃度，800mg/L～1000mg/L，溫度，55℃～60℃，相對濕度60%～80%，作用時間6h。滅菌完成需抽真空。滅菌物品常用可透過環氧乙烷的塑料薄膜密閉包裝。如果在小包裝上帶有可過濾空氣的濾膜，則滅菌效果更好。
4.小型環氧乙烷滅菌器，多用于醫療衛生部門處理少量醫療器械和用品，目前有100%純環氧乙烷或環氧乙烷和二氧化碳混合氣體。這類滅菌器自動化程度比較高，可自動抽真空，自動加藥，自動調節溫度和相對濕度，可自動控制滅菌時間。
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